Berdasarkan Peraturan Menristekdikti RI No. 32 Tahun 2016 tentang Akreditasi Program Studi dan Perguruan Tinggi, maka Prodi S1 Pendidikan IPA beroleh akreditasi minimum yang berlaku selama 4 tahun mulai dari tanggal berdiri 19 Mei 2014 dan SK penyelenggaraan nomor 114/E/O/2014. Adapun saat ini, Prodi S1 Pendidikan IPA terakreditasi LAMDIK dengan peringkat UNGGUL berdasarkan Surat Keputusan LAMDIK Nomor : 8/SK/LAMDIK/Ak/S/I/2023. Sertifikat akreditasi dan SK LAMDIK Prodi S1 Pendidikan IPA, Fakultas MIPA, Universitas Negeri Gorontalo dapat diperoleh melalui unduhan berikut:
| No. | Peringkat Akreditasi | Masa Berlaku | SK/Sertifikat |
| 1 | Akreditasi Minimum | 19 Mei 2014 - 26 Februari 2018 | Download |
| 2 | Akreditasi B | 27 Februari 2018 - 27 Februari 2023 | Download |
| 3 | Akreditasi UNGGUL | 28 Februari 2023 - 27 Februari 2028 | Download |
